在留资格还没失效的情况下，想要撤销申请材料的话需要收回所有原件，并联系受理的审查官，让他注销文件。但一般情况下很难联系得上…… 如果已经在入国管理局留下了违法或不恰当的材料（例如，过去有不良出入境记录、居留期限过长、在留资格取消等不良纪录），那么就有可能对你以后入境日本产生不良影响。 甚至有可能被禁止再次入境。所以，请务必注意。
不过，一般情况是，你申请在留资格的材料如果没有通过或者由于其它原因被退回时，这些材料会被送回原籍，对日后入境并不产生影响； 但如果是在入国管理局留底了相关申请材料，则有可能会对今后入境造成影响，此时应该尽快联系所在地区的入管局办公室，告知需要的资料和理由，并尽可能迅速地重新提出在新申请的手续。
金纛昀优质答主在日本，入境管理局的申请撤销需要通过派遣地区的入国管理厅或者日本国外的日本大使馆或者领事馆来进行。具体步骤如下：
1. 准备所需材料：您需要提供以下文件以证明您的身份：护照（原始及复印本）、回国的机车票或者机票、写好的书信（说明您为何希望撤销申请）等。
2. 填写申请表：在入国管理局的官方网站下载并填写撤销申请的申请表。
3. 提交申请：将所需材料提交给您居住地所在的入国管理厅，或者在日本以外的日本大使馆或领事馆。提交申请时，可能需要支付一定的费用。
4. 等待审批：提交撤销申请后，入管局会对您的申请进行审查。一般在提交申请后的几天到一周内，您会收到关于申请是否被批准的消息。
5. 审批结果：如果申请被批准，您会收到一封确认信。信中会注明您的签证或者进入许可已经被撤销，以及其他的注意事项。如果申请被拒绝，您也需要收到通知，再次提交时可能需要更为详细的解释和说明。
